/*
 * Michel Héon PhD: Web sémantique et modélisation ontologique - Guide du développeur Java sous Eclipse
 * This file is part of the book: 
 * 
 * Michel Héon
 * Web sémantique et modélisation ontologique - Guide du développeur Java sous Eclipse
 * 2014
 * Editions ENI 
 * ISBN : 978-2-7460-8869-6
 * EAN : 9782746088696
 * France
 * 
 * The contents of this file are subject to the LGPL License, Version 3.0.
 *
 * Copyright (C) 2014, Cotechnoe inc. http://www.cotechnoe.com, http://java-ws.com
 *
 * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
 * it under the terms of the GNU General Public License as published by
 * the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
 * (at your option) any later version.
 *
 * This program is distributed in the hope that it will be useful,
 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
 * GNU General Public License for more details.
 *
 * You should have received a copy of the GNU General Public License
 * along with this program.  If not, see http://www.gnu.org/licenses/.
 *
 *
 * Alternatively, the contents of this file may be used under the terms of the Apache License, Version 2.0
 * in which case, the provisions of the Apache License Version 2.0 are applicable instead of those above.
 *
 * Copyright (C) 2014, Cotechnoe inc.
 *
 * Licensed under the Apache License, Version 2.0 (the "License");
 * you may not use this file except in compliance with the License.
 * You may obtain a copy of the License at
 *
 * http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 *
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
 * See the License for the specific language governing permissions and
 * limitations under the License.
 */
package com.java_ws.owlapi.exemple;
import org.coode.owlapi.turtle.TurtleOntologyFormat;
import org.semanticweb.owlapi.apibinding.OWLManager;
import org.semanticweb.owlapi.io.StreamDocumentTarget;
import org.semanticweb.owlapi.model.IRI;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLClass;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLClassAssertionAxiom;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLDataFactory;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLIndividual;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntology;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyCreationException;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyManager;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyStorageException;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLSubClassOfAxiom;
import org.semanticweb.owlapi.util.InferredOntologyGenerator;

import com.clarkparsia.pellet.owlapiv3.PelletReasoner;
import com.clarkparsia.pellet.owlapiv3.PelletReasonerFactory;

public class TestPellet {
    public static void main(String[] args) throws
    OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {
        OWLOntologyManager manager = OWLManager.createOWLOntologyManager();
        IRI ontologyIRI = IRI.create("http://java-ws.com/ontologie/tstpellet.owl");
        OWLDataFactory factory = manager.getOWLDataFactory();
        OWLOntology ontology = manager.createOntology(ontologyIRI);
        OWLClass person = factory.getOWLClass(IRI.create(ontologyIRI + "#Person"));
        OWLClass woman = factory.getOWLClass(IRI.create(ontologyIRI + "#Woman"));
        OWLIndividual mary = factory.getOWLNamedIndividual(IRI.create(ontologyIRI + "#Mary"));
        OWLClassAssertionAxiom maryAxiom = factory.getOWLClassAssertionAxiom(woman, mary);
        OWLSubClassOfAxiom axiom = factory.getOWLSubClassOfAxiom(woman,    person);
        manager.addAxiom(ontology, axiom);
        manager.addAxiom(ontology, maryAxiom);
        manager.saveOntology(ontology, new TurtleOntologyFormat(), new StreamDocumentTarget(System.out));
        PelletReasonerFactory reasonerFactory =    PelletReasonerFactory.getInstance();
        OWLOntology inferOntology = manager.createOntology();
        PelletReasoner reasoner = (PelletReasoner)reasonerFactory.createNonBufferingReasoner(ontology);
        InferredOntologyGenerator iog = new    InferredOntologyGenerator(reasoner);
        iog.fillOntology(manager, inferOntology);
        System.out.println("######################################");
        System.out.println("######################################");
        System.out.println("###### RÉSULTAT APRÈS INFÉRENCE ######");
        System.out.println("######################################");
        System.out.println("#####################################");
        manager.saveOntology(inferOntology, new TurtleOntologyFormat(), new StreamDocumentTarget(System.out));
    }
}