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 * Michel Héon PhD: Web sémantique et modélisation ontologique - Guide du développeur Java sous Eclipse
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 * 
 * Michel Héon
 * Web sémantique et modélisation ontologique - Guide du développeur Java sous Eclipse
 * 2014
 * Editions ENI 
 * ISBN : 978-2-7460-8869-6
 * EAN : 9782746088696
 * France
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 */
package com.java_ws.owlapi.exemple.util;


import java.io.IOException;
import java.io.PrintWriter;
import java.util.Set;

import org.coode.owlapi.manchesterowlsyntax.ManchesterOWLSyntaxOntologyFormat;
import org.coode.owlapi.turtle.TurtleOntologyFormat;
import org.semanticweb.owlapi.io.OWLFunctionalSyntaxOntologyFormat;
import org.semanticweb.owlapi.io.OWLXMLOntologyFormat;
import org.semanticweb.owlapi.io.RDFXMLOntologyFormat;
import org.semanticweb.owlapi.io.StreamDocumentTarget;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLAxiom;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLException;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntology;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyManager;
import org.semanticweb.owlapi.model.OWLOntologyStorageException;
import org.semanticweb.owlapi.reasoner.ConsoleProgressMonitor;
import org.semanticweb.owlapi.reasoner.OWLReasonerConfiguration;
import org.semanticweb.owlapi.reasoner.SimpleConfiguration;
import org.semanticweb.owlapi.util.InferredOntologyGenerator;
import org.semanticweb.owlapi.vocab.PrefixOWLOntologyFormat;

import com.clarkparsia.owlapi.explanation.PelletExplanation;
import com.clarkparsia.owlapi.explanation.io.manchester.ManchesterSyntaxExplanationRenderer;
import com.clarkparsia.pellet.owlapiv3.PelletReasoner;
import com.clarkparsia.pellet.owlapiv3.PelletReasonerFactory;

/** Auteur: Michel Héon PhD
 
 * Cotechnoe http://www.cotechnoe.com

 * Date: 15-jan-2014
 */
@SuppressWarnings("unused")
public class JavawsHelper {
 
        public static void printOntology(OWLOntologyManager manager, PrefixOWLOntologyFormat format, OWLOntology ont) throws OWLOntologyStorageException {
            manager.saveOntology(ont, format, new StreamDocumentTarget(System.out));
            System.out.println("");
        }
        public static void printManchesterOWL(OWLOntologyManager manager, OWLOntology ont) throws OWLOntologyStorageException {
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("#                    ManchesterOWLSyntaxOntologyFormat                            #");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            PrefixOWLOntologyFormat ontologySyntaxFormat = new ManchesterOWLSyntaxOntologyFormat();
            ontologySyntaxFormat.setDefaultPrefix(ont.getOntologyID().getOntologyIRI()+ "#");
            manager.saveOntology(ont, ontologySyntaxFormat, new StreamDocumentTarget(System.out));
        }

        public static void printFunctionalOWL(OWLOntologyManager manager, OWLOntology ont) throws OWLOntologyStorageException {
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("#                    OWLFunctionalSyntaxOntologyFormat                            #");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            PrefixOWLOntologyFormat ontologySyntaxFormat = new OWLFunctionalSyntaxOntologyFormat();
            ontologySyntaxFormat.setDefaultPrefix(ont.getOntologyID().getOntologyIRI()+ "#");
            manager.saveOntology(ont, ontologySyntaxFormat, new StreamDocumentTarget(System.out));
        }

        public static void printXMLOntology(OWLOntologyManager manager, OWLOntology ont) throws OWLOntologyStorageException {
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("#                    OWLXMLOntologyFormat                                         #");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            PrefixOWLOntologyFormat ontologySyntaxFormat = new OWLXMLOntologyFormat();
            ontologySyntaxFormat.setDefaultPrefix(ont.getOntologyID().getOntologyIRI()+ "#");
            manager.saveOntology(ont, ontologySyntaxFormat, new StreamDocumentTarget(System.out));
        }
        public static void printTurtle(OWLOntologyManager manager, OWLOntology ont) throws OWLOntologyStorageException {
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("#                    TurtleOntologyFormat                                         #");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            PrefixOWLOntologyFormat ontologySyntaxFormat = new TurtleOntologyFormat();
            ontologySyntaxFormat.setDefaultPrefix(ont.getOntologyID().getOntologyIRI()+ "#");
            manager.saveOntology(ont, ontologySyntaxFormat, new StreamDocumentTarget(System.out));
        }
        public static void printRDFXML(OWLOntologyManager manager, OWLOntology ont) throws OWLOntologyStorageException {
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("#                    RDFXMLOntologyFormat                                         #");
            System.out.println("###################################################################################");
            System.out.println("###################################################################################");
            PrefixOWLOntologyFormat ontologySyntaxFormat = new RDFXMLOntologyFormat();
            ontologySyntaxFormat.setDefaultPrefix(ont.getOntologyID().getOntologyIRI()+ "#");
            manager.saveOntology(ont, ontologySyntaxFormat, new StreamDocumentTarget(System.out));
        }
        public static void infererOntologie(OWLOntologyManager manager, OWLOntology ontology) throws UnsupportedOperationException, OWLException, IOException  {

            PelletReasonerFactory reasonerFactory = PelletReasonerFactory.getInstance();

            OWLOntology inferOntology = manager.createOntology();
            ConsoleProgressMonitor progressMonitor = new ConsoleProgressMonitor();
            OWLReasonerConfiguration config = new SimpleConfiguration(progressMonitor);
    
            PelletReasoner  reasoner = (PelletReasoner) reasonerFactory.createNonBufferingReasoner(ontology, config);
            System.out.println("Is consistance ? Rep: "+reasoner.isConsistent());

            if (reasoner.isConsistent())
            {
                InferredOntologyGenerator iog = new InferredOntologyGenerator(reasoner);
                iog.fillOntology(manager, inferOntology);
                // Imprimer l'ontologie inférée
                PrefixOWLOntologyFormat ontologySyntaxFormat = new TurtleOntologyFormat();
                ontologySyntaxFormat.setDefaultPrefix(ontology.getOntologyID().getOntologyIRI()+ "#");;
                manager.saveOntology(inferOntology, ontologySyntaxFormat, new StreamDocumentTarget(System.out));
            }
            PelletExplanation expGen = new PelletExplanation( reasoner );
            Set> exp = expGen.getInconsistencyExplanations();
            imprimerExplication(exp);
        }
        /*
         * Méthode d'impression d'une explication dans la notation Manchester
         */
        public static void imprimerExplication(Set> exp) throws UnsupportedOperationException, OWLException, IOException{
            ManchesterSyntaxExplanationRenderer renderer = new ManchesterSyntaxExplanationRenderer();
            PrintWriter out = new PrintWriter( System.out );
            renderer.startRendering( out );
            renderer.render( exp );        
            renderer.endRendering();
        }

}